RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF773Q6PK81 442 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6ZVU0 165 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIB2Q92519 343 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EGLN2Q96KS0 407 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ART5Q96L15 291 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PSKH2Q96QS6 385 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VPS51Q9UID3 782 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ASF1AQ9Y294 204 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1W2PRU2 124 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 M0R129 80 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VIPP01282 170 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BMP2P12643 396 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BMXP51813 675 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBA4AP68366 448 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CD47Q08722 323 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SERINC5Q86VE9 423 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKFN1Q8N957 763 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FNDC8Q8TC99 324 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KAT2AQ92830 837 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM203Q969S6 136 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF208Q9H0X6 261 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TLR9Q9NR96 1032 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MALT1Q9UDY8 824 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MANBAO00462 879 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXA2O43364 376 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CLPXO76031 633 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C8BP07358 591 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BCKDHAP12694 445 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 IL12AP29459 219 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NCS1P62166 190 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF33AQ06730 810 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC13A2Q13183 592 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP6AP1Q15904 470 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf183Q5T699 404 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SGCDQ92629 289 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MAL2Q969L2 176 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EQTNQ9NQ60 294 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP11A1P05108 521 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SP3Q02447 781 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NFATC3Q12968 1075 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ING5Q8WYH8 240 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PPCDCQ96CD2 204 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PKP4Q99569 1192 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 INPP5KQ9BT40 448 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MYL12BO14950 172 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CCL16O15467 120 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ABCB7O75027 752 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 APOL3O95236 402 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SOX14O95416 240 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC6A4P31645 630 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 WASP42768 502 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EMX2Q04743 252 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SMARCB1Q12824 385 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC66Q68CR7 880 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.46□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM171BQ6P995 826 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms