RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FYNP06241 537 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52Z1P0C646 297 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 GNB3P16520 340 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP11B2P19099 503 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ACHEP22303 614 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CA6P23280 308 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP2K2P36507 400 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MNDAP41218 407 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LIMK1P53667 647 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 RBPJQ06330 500 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR17Q13304 367 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CST9LP1Q5W188 147 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 DET1Q7L5Y6 550 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EID3Q8N140 333 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 RMDN1Q96DB5 314 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 GIMAP5Q96F15 307 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 FEVQ99581 238 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 NUP85Q9BW27 656 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MIS12Q9H081 205 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10A4Q9H209 315 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 GKN1Q9NS71 199 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF21Q9NSA1 209 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MDFICQ9P1T7 246 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM17Q9Y577 477 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 DISP3Q9P2K9 1392 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EML2O95834 649 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CEACAM1P13688 526 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGER4P35408 488 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT5AP41221 380 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LHX1P48742 406 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ASCL1P50553 236 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ10P78508 379 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CDR2Q01850 454 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSM1Q08AH1 577 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF10Q12962 218 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF13Q15543 124 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ODF4Q2M2E3 257 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 XKR3Q5GH77 459 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT39Q6A163 491 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGZQ86VD9 579 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK20Q8IZL9 346 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LRR1Q96L50 414 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CPNE1Q99829 537 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ENO4A6NNW6 628 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 EDIL3O43854 480 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM157CP0CG43 387 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 CD22P20273 847 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 CCR10P46092 362 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD23AP54725 363 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL3Q13618 768 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGA7Q13683 1181 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 VEZF1Q14119 521 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 UGP2Q16851 508 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 GTDC1Q4AE62 458 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST3Q7LGC8 479 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 BMPERQ8N8U9 685 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52N5Q8NH56 324 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms