RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CALML3P27482 149 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CHKAP35790 457 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PRPHP41219 470 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEA1P43355 309 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GNGT1P63211 74 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SORDQ00796 357 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 STK4Q13043 487 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 KIR2DS3Q14952 304 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SBK1Q52WX2 424 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF766Q5HY98 468 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CENPPQ6IPU0 288 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 IQCA1Q86XH1 822 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CD302Q8IX05 232 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CNPY4Q8N129 248 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MREGQ8N565 214 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 P2RX5Q93086 422 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ZIM3Q96PE6 472 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PLIN2Q99541 437 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CUEDC2Q9H467 287 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SH2D4AQ9H788 454 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GDF3Q9NR23 364 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 EHD2Q9NZN4 543 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 DCCP43146 1447 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PHLPP1O60346 1717 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 FLT1P17948 1338 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 BCL9O00512 1426 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 BICDL2A1A5D9 508 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GAGE10A6NGK3 116 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF233A6NK53 670 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 LAD1O00515 517 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 EPHB6O15197 1021 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SEC14L5O43304 696 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 HSF2BPO75031 334 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ERLIN2O94905 339 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 EGFP01133 1207 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TSHBP01222 138 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 HOXB5P09067 269 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 UBA7P41226 1012 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R2P41236 205 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GYG1P46976 350 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP12-2P59991 146 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 UBE4AQ14139 1066 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SPA17Q15506 151 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP58Q5T655 872 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT17Q6IS24 598 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 EMBQ6PCB8 327 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 GPR180Q86V85 440 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MYCT1Q8N699 235 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 AMER3Q8N944 861 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD8Q96I13 439 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 MS4A14Q96JA4 679 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC42Q96M95 316 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms