RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 OXR1Q8N573 874 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CBSLP0DN79 551 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CBSP35520 551 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN4P51793 760 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NAT14Q8WUY8 206 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AUTS2Q8WXX7 1259 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ETAA1Q9NY74 926 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SNX7Q9UNH6 387 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PEX16Q9Y5Y5 336 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CLIC1O00299 241 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC18A2Q05940 514 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZVU0 165 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PJA1Q8NG27 643 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM2Q9C040 744 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TDP1Q9NUW8 608 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 H6PDO95479 791 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ADH5P11766 374 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA11P43364 429 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SPIN4Q56A73 249 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPR153Q6NV75 609 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NAPRTQ6XQN6 538 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF4L2Q8NA75 395 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 OR52B2Q96RD2 323 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DPPA5A6NC42 116 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM150CB9EJG8 249 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 EPOP01588 193 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCHP24723 683 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MYLK3Q32MK0 819 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 LRRTM4Q86VH4 590 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CCM2Q9BSQ5 444 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TVP23BQ9NYZ1 205 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 EI24O14681 340 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT3O60678 531 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF12O95522 483 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TGFB1P01137 390 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ALPPP05187 535 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CDH1P12830 882 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IL12BP29460 328 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RPL26P61254 145 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SCN1BQ07699 218 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.778e-7■■■■□ 24.4
CCSAP-203ENST00000366687 DAG1Q14118 895 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 XKR4Q5GH76 650 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A6Q6NXT4 461 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NRSN1Q8IZ57 195 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CMTM8Q8IZV2 173 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SMPDL3AQ92484 453 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf16Q9NQ32 467 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MTX2O75431 263 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ALPPL2P10696 532 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 VIPR1P32241 457 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 STARP49675 285 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL22Q53GT1 634 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 PRR23BQ6ZRT6 265 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 EBF3Q9H4W6 596 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ANKHQ9HCJ1 492 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4AQ9UMR7 237 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF487B1APH4 448 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 SLC11A1P49279 550 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 SEPHS1P49903 392 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 LCN1P1Q5VSP4 162 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R2DQ66LE6 453 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 RGMAQ96B86 450 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 SIPA1Q96FS4 1042 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 TRPV5Q9NQA5 729 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 LCHNA4D1U4 455 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 GJA1P17302 382 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 MAGP20916 626 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 GHRHRQ02643 423 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 OLFML2AQ68BL7 652 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP14Q86UN6 197 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 FAM110BQ8TC76 370 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 RAB2BQ8WUD1 216 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 HTRA1Q92743 480 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM39Q9HCM9 518 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A14Q9Y267 594 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD8Q6ZWB6 473 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 RAB43Q86YS6 212 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms