RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A4Q9UP95 1085 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE15A4D2H0 777 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L23D6RBM5 183 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EBAG9O00559 213 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PLSCR1O15162 318 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYP27B1O15528 508 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 E2F6O75461 281 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CDKL5O76039 1030 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TFP02787 698 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINF2P08697 491 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IRF1P10914 325 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5JP18859 108 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1C1P21283 382 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MYF6P23409 242 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCHP24723 683 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SHMT1P34896 483 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GATMP50440 423 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PER3P56645 1201 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SIRPAP78324 504 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MECOMQ03112 1051 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RBPJQ06330 500 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IQCCQ4KMZ1 466 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAB6CQ53S08 254 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AADACL4Q5VUY2 407 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CASC4Q6P4E1 433 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BEND4Q6ZU67 534 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NECAB1Q8N987 351 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ALG3Q92685 438 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OMA1Q96E52 524 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PHACTR3Q96KR7 559 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TSGA10Q9BZW7 698 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC90BQ9GZT6 254 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MIS12Q9H081 205 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UBQLN3Q9H347 655 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK15Q9H427 330 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEF1Q9HAY2 307 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 VCX3AQ9NNX9 186 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PANK4Q9NVE7 773 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UPB1Q9UBR1 384 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAD2L2Q9UI95 211 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSME2Q9UL46 239 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 V9GYQ6 96 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM265A0A087WTH1 108 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0U1RQF3 1178 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 F8W810 466 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MYO1CO00159 1063 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RASGRF2O14827 1237 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NVLO15381 856 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ST8SIA3O43173 380 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FCGR3BO75015 233 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF254O75437 659 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TOX4O94842 621 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR6B1O95007 311 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERPIND1P05546 499 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MMP10P09238 476 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ITIH1P19827 911 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CSF2RBP32927 897 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CD97P48960 835 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CXCR3P49682 368 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NPEPPSP55786 919 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PDE7AQ13946 482 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3GAP1Q15042 981 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STK11Q15831 433 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MDGA2Q7Z553 956 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ERO1BQ86YB8 467 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CNGA4Q8IV77 575 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa2.44□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms