RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SOBPA7XYQ1 873 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 LATS1O95835 1130 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA5P08758 320 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CBSLP0DN79 551 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PCSK2P16519 638 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CBSP35520 551 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CSKP41240 450 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MLLT10P55197 1068 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PIGFQ07326 219 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 AQP6Q13520 282 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD11Q8NFV4 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 FRS2Q8WU20 508 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D20Q96BZ9 403 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 RRAGCQ9HB90 399 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 FUOMA2VDF0 154 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf78A6NCI8 922 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CA12O43570 354 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ELNP15502 786 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PORP16435 677 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BPIP17213 487 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PRKACGP22612 351 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 IGFBP5P24593 272 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 OR1D2P34982 312 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 GGT5P36269 586 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SPAM1P38567 509 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 GP2P55259 537 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PHC1P78364 1004 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 KCNC4Q03721 635 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BCL2L1Q07817 233 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CES5AQ6NT32 575 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CHPFQ8IZ52 775 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 NXPE1Q8N323 547 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PARP8Q8N3A8 854 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PAF1Q8N7H5 531 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TESCQ96BS2 214 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF347Q96SE7 839 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SLC32A1Q9H598 525 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 U3KQV3 271 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 M0QX08 132 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ARVCFO00192 962 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SOCS5O75159 536 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFS2O75306 463 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN7O95471 211 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MAPK1P28482 360 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PTPN6P29350 595 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MAPK8P45983 427 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PSMD7P51665 324 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CDK5R2Q13319 367 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CDH18Q13634 790 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ATP1A4Q13733 1029 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ACOX1Q15067 660 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CHRNA6Q15825 494 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CPZQ66K79 652 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 NPAS4Q8IUM7 802 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf111Q8N326 155 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM88BA6NKF7 163 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PTGES3LE9PB15 166 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 K7ERQ8 282 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 HOXA2O43364 376 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 UGT2B11O75310 529 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 INMTO95050 263 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CCNDBP1O95273 360 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ANGPTL1O95841 491 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PDYNP01213 254 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PFKLP17858 780 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 RPL17P18621 184 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PRPH2P23942 346 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 HNF1BP35680 557 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 IL5RAQ01344 420 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 OCA2Q04671 838 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PLD1Q13393 1074 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CTF1Q16619 201 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CDKN3Q16667 212 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 RETSATQ6NUM9 610 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 NIPAL1Q6NVV3 410 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00299Q6ZSB3 139 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TPGS1Q6ZTW0 290 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 IGFN1Q86VF2 1251 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3C3Q8NEB9 887 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ALG14Q96F25 216 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms