RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 IFI44Q8TCB0 444 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 FBXL8Q96CD0 374 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ZMYND15Q9H091 742 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 XKR8Q9H6D3 395 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 WWOXQ9NZC7 414 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CFAP54Q96N23 3096 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MYL2P10916 166 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PKLRP30613 574 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 GPLD1P80108 840 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 GRB7Q14451 532 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PFKFB4Q16877 469 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 OOSP2Q86WS3 158 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 RDH11Q8TC12 318 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CCDC126Q96EE4 140 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 IL17FQ96PD4 163 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ICKQ9UPZ9 632 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 U3KQA8 63 aa20.51■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 KRT87PA6NCN2 255 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 OR6C74A6NCV1 312 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CBFA2T3O75081 653 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PROCP04070 461 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PROS1P07225 676 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 NR1D2Q14995 579 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CYP2A13Q16696 494 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PIP4P1Q86T03 277 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PDPRQ8NCN5 879 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ZNF480Q8WV37 535 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SMPDL3AQ92484 453 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MED8Q96G25 268 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ABCG4Q9H172 646 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TMEM120BA0PK00 339 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 DUX1O43812 170 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 GP1BAP07359 652 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CPA3P15088 417 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TYRP1P17643 537 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CCND1P24385 295 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ACP1P24666 158 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 IMPA1P29218 277 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 OR1D5P58170 312 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 AMZ1Q400G9 498 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PHF21BQ96EK2 531 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 EMCNQ9ULC0 261 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.49■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PIPSLA2A3N6 862 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MATN2O00339 956 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MTHFD2P13995 350 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SLC18A1P54219 525 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 NAE1Q13564 534 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 SPRED1Q7Z699 444 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 MENTQ9BUN1 341 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 GSAPA4D1B5 854 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 C2orf74A8MZ97 194 aa20.48■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TARM1B6A8C7 271 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms