RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 HLA-EP13747 358 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMB9P28065 219 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TNFSF8P32971 234 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 POU3F4P49335 361 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 EPHA5P54756 1037 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 OGDHQ02218 1023 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SCN1BQ07699 218 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 POU4F3Q15319 338 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 STXBP2Q15833 593 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TATDN3Q17R31 274 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PPM1JQ5JR12 505 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC6A19Q695T7 634 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RNF145Q96MT1 663 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CNPY3Q9BT09 278 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PORCNQ9H237 461 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PIGUQ9H490 435 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GAREM1Q9H706 876 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 USTQ9Y2C2 406 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 C5orf42Q9H799 3197 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 EFCAB7A8K855 629 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PTGES3LE9PB15 166 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 VPS26AO75436 327 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 WDR47O94967 919 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 APOL3O95236 402 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 IL6P05231 212 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 FGF2P09038 288 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 HSMCR30P0CW71 290 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 HDCP19113 662 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KDELR1P24390 212 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GRIA4P48058 902 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP4Q13115 394 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KEAP1Q14145 624 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RFX4Q33E94 735 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ELP2Q6IA86 826 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF425Q6IV72 752 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CHPFQ8IZ52 775 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TNS4Q8IZW8 715 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SPATA18Q8TC71 538 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ELMO1Q92556 727 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 HGDQ93099 445 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 NAT9Q9BTE0 207 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ALG2Q9H553 416 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 MROH8Q9H579 483 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF358Q9NW07 568 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CPA4Q9UI42 421 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ALG5Q9Y673 324 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 E2F8A0AVK6 867 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 F8VP50 259 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 WRBO00258 174 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 MYL12BO14950 172 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 RGS10O43665 173 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 XPNPEP2O43895 674 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 MLNP12872 115 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ARSBP15848 533 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 MYL12AP19105 171 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 HK1P19367 917 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms