RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 RASGRP1O95267 797 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 AHSGP02765 367 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MVKQ03426 396 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TPK1Q9H3S4 243 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ABCB9Q9NP78 766 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ENPP3O14638 875 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NIPSNAP2O75323 286 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CRISP3P54108 245 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PHC1P78364 1004 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SPIN4Q56A73 249 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 BORCS6Q96GS4 357 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ARPC2O15144 300 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OR52B2Q96RD2 323 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 DERL2Q9GZP9 239 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OSER1Q9NX31 292 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PPEF2O14830 753 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 WNT9AO14904 365 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 INHAP05111 366 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 S100GP29377 79 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 RORCP51449 518 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PRKCZQ05513 592 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TUBA3CQ13748 450 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MSS51Q4VC12 460 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TMEM198Q66K66 360 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 AMZ2Q86W34 360 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SNX33Q8WV41 574 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NUS1Q96E22 293 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UPB1Q9UBR1 384 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 YIPF1Q9Y548 306 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 H0YGN5 161 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CLCN4P51793 760 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PITPNAQ00169 270 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 LMLNQ96KR4 655 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CGREF1Q99674 301 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 COPS4Q9BT78 406 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NFS1Q9Y697 457 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 A0A1W2PRB8 838 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 HAS3O00219 553 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 EI24O14681 340 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 B3GALT2O43825 422 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PRLP01236 227 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 YES1P07947 543 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IST1P53990 364 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CADM2Q8N3J6 435 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 RNF39Q9H2S5 420 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MKLN1Q9UL63 735 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PDLIM1O00151 329 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PRAMEF10O60809 474 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GIMD1P0DJR0 217 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 WASP42768 502 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SCARB2Q14108 478 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MOGQ16653 247 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PQLC3Q8N755 202 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CFL2Q9Y281 166 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM25EA8MYX2 175 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TBX18O95935 607 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT1A6P19224 532 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT1A1P22309 533 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT1A4P22310 534 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT1A3P35503 534 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MBLAC2Q68D91 279 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C5orf34Q96MH7 638 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OR2AG1Q9H205 316 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms