RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mul1Q8VCM5 352 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NcaldQ91X97 193 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Uqcc2Q9CQY6 136 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Susd3Q9D176 269 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep83Q9D5R3 692 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SufuQ9Z0P7 484 aa12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm7971J3QMM8 481 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alkal1J3QPP8 127 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Capn5O08688 640 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Unc5cO08747 931 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TrhrP21761 393 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GhrhrP32082 423 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccr3P51678 359 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Msto1Q2YDW2 556 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8773Q3UQ24 132 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp868Q3UTQ6 422 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PdprQ7TSQ8 878 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrif1Q8CDD9 755 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Syvn1Q9DBY1 612 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olig2Q9EQW6 323 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Upk3aQ9JKX8 287 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm9573F7C950 1606 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Obox5G3X9P6 291 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zp3P10761 424 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Esr1P19785 599 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Grin2cQ01098 1239 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam196aQ3USH1 422 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fut10Q5F2L2 481 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 OsgepQ8BWU5 335 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc22a6Q8VC69 545 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Uts2rQ8VIH9 385 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmprss6Q9DBI0 811 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il22Q9JJY9 179 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rai2Q9QVY8 529 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam83cA2ARK0 776 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1513L7N457 313 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CratP47934 626 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FerP70451 823 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Foxk2Q3UCQ1 651 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 KdsrQ6GV12 332 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp324Q78F42 583 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sgo2Q7TSY8 1164 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mptx1Q8R1M8 219 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slf1Q8R3P9 1054 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm26657Q9CVR1 127 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FopnlQ9CZS3 174 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9DAR0 182 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dmap1Q9JI44 468 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Actl7bQ9QY83 418 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atg2bQ80XK6 2075 aa12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5751A2AHC8 147 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Phf11A6H5X4 337 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ptar1E9QAB6 424 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp946F6VWU8 523 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r4K7N784 913 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fv4P11370 679 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Csf2rb2P26954 878 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab21P35282 222 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mep1bQ61847 704 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1051Q7TR76 308 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trmt12Q8BG71 446 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxo46Q8BG80 603 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fjx1Q8BQB4 450 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Galnt13Q8CF93 556 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lin7aQ8JZS0 233 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BlmhQ8R016 455 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1310Q8VF85 312 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr353Q8VGK0 311 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4930513O06RikQ9D549 161 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21885A0A286YDN8 145 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm20721E9Q2U8 318 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ackr2O08707 378 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc32a1O35633 525 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ncam1P13595 1115 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PimregQ8BFY7 231 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr868Q8VFI8 309 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr853Q8VGG6 305 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhb21Q91V48 774 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NlnQ91YP2 704 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim33Q99PP7 1142 aa12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AasdhpptQ9CQF6 309 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms