RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DnpepQ9Z2W0 473 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A6H6Q4 206 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r54K7N649 806 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 E2f3O35261 457 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gas2P11862 314 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Resp18P47939 175 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npy2rP97295 381 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pacs2Q3V3Q7 862 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spata48Q5NC83 441 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bdkrb1Q61125 334 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TufmQ8BFR5 452 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc16a12Q8BGC3 486 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfm2Q8BM13 448 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C5ar2Q8BW93 344 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gykl1Q8C635 549 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr352Q8VGJ9 315 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1250Q8VGM3 314 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sp7Q8VI67 428 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc15a4Q91W98 574 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlg2Q91XM9 852 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fundc2Q9D6K8 151 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smg9Q9DB90 520 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IgtpQ9DCE9 423 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifi30Q9ESY9 248 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ralgps1A2AR50 585 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc23lA6H6E9 458 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r50E9PW61 861 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r176G3UW31 304 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pbx2O35984 430 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stc1O55183 247 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Btnl2O70355 454 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmd7P26516 321 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mkl2P59759 1080 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr616Q3KPB0 317 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxk2Q3UCQ1 651 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipcef1Q5DU31 406 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LpoQ5SW46 710 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sox17Q61473 419 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 XpaQ64267 272 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q6P2K3 674 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnma8aQ80VM8 430 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan12Q8BKT6 305 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MylipQ8BM54 445 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GmppbQ8BTZ7 360 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abi3Q8BYZ1 367 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cers6Q8C172 384 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mtrf1Q8K126 446 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CenpiQ8K1K4 746 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr697Q8VFM4 317 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp6v1c2Q99L60 427 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NwcQ9CQI4 244 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sesn3Q9CYP7 492 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cmtm7Q9ESD6 167 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn19Q9ET38 224 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rdh11Q9QYF1 316 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oaz3Q9R109 243 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rad21l1A2AU37 552 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1121L7MTT1 314 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acvr2aP27038 513 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Upp1P52624 311 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akr1clQ3UXL1 322 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plk5Q4FZD7 595 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrm3Q5ND52 418 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lemd2Q6DVA0 511 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bhlhb9Q6PB60 539 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr171Q8BG55 319 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Insig1Q8BGI3 259 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mettl3Q8C3P7 580 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8C4P0 716 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DcxrQ91X52 244 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Themis3Q9CU24 569 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly6kQ9CWP4 154 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hm13Q9D8V0 378 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GabarapQ9DCD6 117 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AgkQ9ESW4 421 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxo8Q9QZN3 319 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcm1Q9R0L6 2025 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1153A2AVC0 318 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm8267E9Q207 261 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HgdO09173 445 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tpst1O70281 370 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugt2b17P17717 530 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akr1c6P70694 323 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps3aP97351 264 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem184cQ3TPR7 525 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms