RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kir3dl2Q673W2 388 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Otud6aQ6IE21 290 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PdprQ7TSQ8 878 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ubp1Q811S7 540 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Samd7Q8C8Y5 445 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DdoQ922Z0 341 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp4f13Q99N19 523 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifi44lQ9BDB7 447 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ProdhQ9WU79 599 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2-T24F8VQG4 363 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8BGK9 164 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eme1Q8BJW7 570 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cops8Q8VBV7 209 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dennd2dQ91VV4 469 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spz1Q99MY0 378 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim33Q99PP7 1142 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Panx1Q9JIP4 426 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mid2Q9QUS6 705 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 UxtQ9WTZ0 157 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1200A2ATJ4 336 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rad21l1A2AU37 552 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm2956E9PVJ0 216 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm7275E9Q1B3 247 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr292F8VQ84 308 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Alkal1J3QPP8 127 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8108K7N734 216 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3488M0QW81 238 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NapsaO09043 419 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GzmkO35205 263 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BrafP28028 804 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdx1P52946 284 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hrh1P70174 488 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zmat1Q3V0C1 714 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Paqr9Q6TCG2 375 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1313Q7TQW8 311 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf668Q8K2R5 619 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1414Q8VGU5 312 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc35b2Q91ZN5 431 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dctn2Q99KJ8 402 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tomm70Q9CZW5 611 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mgat4dQ9D4R2 373 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sypl1O09117 261 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dgcr6O35347 198 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 OstnP61364 130 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Naf1Q3UMQ8 489 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Glb1l2Q3UPY5 636 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MlipQ5FW52 269 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrch3Q8BVU0 778 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhga11Q91XY8 933 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Csf3rP40223 837 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HpcaP84075 193 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdcd4Q61823 469 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itga2Q62469 1178 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmcc2Q80W04 706 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Efemp1Q8BPB5 493 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2j9Q924D1 502 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr55Q9CX97 388 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smok1Q9QYZ4 484 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cldn7Q9Z261 211 aa8.3□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp275G3X904 499 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kbtbd2G3X9X1 623 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r8L7N472 848 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gria2P23819 883 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 VegfbP49766 207 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MtpnP62774 118 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sec1P97353 368 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc10a7Q5PT53 340 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Galnt7Q80VA0 657 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arhgap19Q8BRH3 494 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Camk1Q91YS8 374 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gstt3Q99L20 241 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acbd7Q9D258 88 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fbxo47A2A6H3 451 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r38G3UYA8 861 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r33K7N705 861 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Alox8O35936 677 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 LifP09056 203 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rrm2P11157 390 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dab1P97318 588 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bcl2a1Q07440 172 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kctd21Q3URF8 260 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 WhammQ571B6 793 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc2a12Q8BFW9 622 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TtpaQ8BWP5 278 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rcor1Q8CFE3 480 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Batf2Q8R1H8 277 aa8.29□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r185Q8R299 319 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms