RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fgfr3Q61851 801 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tfdp2Q64163 446 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Krt73Q6NXH9 539 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klhdc10Q6PAR0 439 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dnajc6Q80TZ3 938 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il17rdQ8JZL1 738 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dusp19Q8K4T5 220 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Otud1Q9CUB6 454 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc10a6Q9CXB2 373 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cfap57Q9D180 1249 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Erv3Q9DAX3 200 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cts6Q9ET52 334 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vwa7Q9JHA8 891 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prss16Q9QXE5 509 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc8a3S4R2P9 928 aa18.28■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pgm2A2CEK3 580 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc35g2D3YVE8 412 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smpd5D6MZJ6 483 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itga10E9Q6R1 1167 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm17067E9Q6S4 354 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 CrymO54983 313 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 HcrtO55241 130 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dhcr7O88455 471 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp26P10076 861 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sirt6P59941 334 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chp1P61022 195 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pros1Q08761 675 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q3U4G0 281 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 StradaQ3UUJ4 431 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5935Q497S0 212 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 PstkQ8BP74 359 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 TtpaQ8BWP5 278 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nmur2Q8BZ39 395 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gramd4Q8CB44 633 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 C1saQ8CG14 688 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r185Q8R299 319 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1325Q8VF43 315 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1512Q8VF72 313 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr382Q8VF79 312 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sec14l2Q99J08 403 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdca3Q99M54 266 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 2610042L04RikQ9D073 150 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sp5Q9JHX2 398 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 TrehQ9JLT2 576 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nme3Q9WV85 169 aa18.27■□□□□ 0.52
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm3182K7N6T8 263 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 NumblO08919 604 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 XlrP05531 208 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tubgcp3P58854 905 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tial1P70318 392 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptprn2P80560 1001 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtf1Q07243 675 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Garnl3Q3V0G7 1038 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acbd3Q8BMP6 525 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nudt9Q8BVU5 350 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 BtdQ8CIF4 520 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Amdhd2Q8JZV7 409 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il17cQ8K4C5 194 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdc16Q8R349 620 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 DgkgQ91WG7 788 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 RabifQ91X96 123 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chil4Q91Z98 402 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf144aQ925F3 292 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Asf1aQ9CQE6 204 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Golph3Q9CRA5 298 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Msh5Q9QUM7 833 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fut8Q9WTS2 575 aa18.26■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lgr4A2ARI4 951 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1164A2AVT5 326 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nt5c1aA3KFX0 365 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 SrsxB2RZI1 361 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcng2F7A6P6 480 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nkx3-2P97503 333 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Glycam1Q02596 151 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10644Q3TZG3 87 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cfhr1Q61406 343 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shc4Q6S5L9 626 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ssxb10Q6XAR7 170 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Far2Q7TNT2 515 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cfap36Q8C6E0 343 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gramd1cQ8CI52 457 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr700Q8VFM5 316 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spred1Q924S8 444 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trem2Q99NH8 227 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adck1Q9D0L4 525 aa18.25■□□□□ 0.51
Ltb-201ENSMUST00000025262 HrgQ9ESB3 525 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32 ms