RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2I	P78347	998 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZVU0	165 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCA2	P51531	1590 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	RASA1	P20936	1047 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN10	P78369	228 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ADH1A	P07327	375 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ERCC3	P19447	782 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	PTK7	Q13308	1070 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L21	D6R901	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	TCF3	P15923	654 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIOB	Q8N635	442 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	PSME1	Q06323	249 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	DKK1	O94907	266 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	GNRH1	P01148	92 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	PTGIR	P43119	386 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SIX5	Q8N196	739 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGXB3	Q12766	1538 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	AXIN1	O15169	862 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	RELB	Q01201	579 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SCNN1D	P51172	638 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	DPYD	Q12882	1025 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PRU2	124 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	GDF10	P55107	478 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	UPP2	O95045	317 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	INHA	P05111	366 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	WIZ	O95785	1651 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23

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