RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	NME9	Q86XW9	330 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	CUL7	Q14999	1698 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	MYL6B	P14649	208 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	RAD21	O60216	631 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	IL16	Q14005	1332 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	EVA1C	P58658	441 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FBLN1	P23142	703 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FAM193A	P78312	1265 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	MEIS3	Q99687	375 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PTPRC	P08575	1304 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FLII	Q13045	1269 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806		G3V3G9	751 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NEMF	O60524	1076 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PDE1A	P54750	535 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TXLNA	P40222	546 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NSD2	O96028	1365 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	BIN1	O00499	593 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CTAGE5	O15320	804 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	IGSF3	O75054	1194 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	EPS15	P42566	896 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	CDKL5	O76039	1030 aa		13.08	□□□□□ -0.31
BECN1-222	ENST00000617806	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31

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