RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DNAI2Q9GZS0 605 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 RAB11FIP3O75154 756 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 KRT85P78386 507 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MRE11P49959 708 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 15.5
TNS1-221ENST00000615025 TNMDQ9H2S6 317 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SLC5A1P13866 664 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DEF6Q9H4E7 631 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 NEBLO76041 1014 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 NEFHP12036 1026 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 IDI1Q13907 227 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 PPFIBP1Q86W92 1011 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MINDY4BA8MYZ0 360 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 H0YHG0 523 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CCDC66A2RUB6 948 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SLFN5Q08AF3 891 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 NAIPQ13075 1403 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 HYPKQ9NX55 129 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CCDC192P0DO97 292 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 FANCAO15360 1455 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 TNIP1Q15025 636 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CEP57L1Q8IYX8 460 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SPATA32Q96LK8 384 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MAP3K12Q12852 859 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CFAP45Q9UL16 551 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ABCC5O15440 1437 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 SLF2Q8IX21 1173 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 MX1P20591 662 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 NAPBQ9H115 298 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 ABCC11Q96J66 1382 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.83□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
TNS1-221ENST00000615025 NOS1P29475 1434 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 GPTP24298 496 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 SPC24Q8NBT2 197 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CCDC181Q5TID7 509 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CBFA2T2O43439 604 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 C6orf229H3BNL8 230 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 DDX11Q96FC9 970 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 WDR97A6NE52 1622 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 A0A087WZG4 1122 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 MSH6P52701 1360 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 NCOA1Q15788 1441 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CCDC96Q2M329 555 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 POTEJP0CG39 1038 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD62A6NC57 917 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CHMP4BP1P59074 171 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 SCLT1Q96NL6 688 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 F6X3S4 739 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 RFC4P35249 363 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 TNRQ92752 1358 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.8□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TNS1-221ENST00000615025 CUL5Q93034 780 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms