RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 KDRP35968 1356 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD54-211ENST00000609454 C5P01031 1676 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD54-211ENST00000609454 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.83■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.81■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 GNPATO15228 680 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 YY1P25490 414 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 SSFA2P28290 1259 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 ITPK1Q13572 414 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 C4BP0C0L5 1744 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 GPR162Q16538 588 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 NUDCQ9Y266 331 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K5Q99683 1374 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 SMIM5Q71RC9 77 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 LGR6Q9HBX8 967 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-211ENST00000609454 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP2R1AP30153 589 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 RFC4P35249 363 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 ADRA2BP18089 450 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 TEFQ10587 303 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 RPS6KA4O75676 772 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 PRKAR2BP31323 418 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC39A6Q13433 755 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 NEFMP07197 916 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 MMP10P09238 476 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.58■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIN3BO60391 1043 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 FCHSD2O94868 740 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 ZPR1O75312 459 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 IL17REQ8NFR9 667 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 MRC1P22897 1456 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 GYS1P13807 737 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 STARD3NLO95772 234 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 BTBD11A6QL63 1104 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF790Q6PG37 636 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 RALBP1Q15311 655 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 MCM10Q7L590 875 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 TJP1Q07157 1748 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-211ENST00000609454 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 FKBP8Q14318 412 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 UTRNP46939 3433 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 TGFB2P61812 414 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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