RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608879.1

SYT6-204, Transcript of synaptotagmin 6, human

TSL 5

Gene SYT6, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYT6-204	ENST00000608879	POLD1	P28340	1107 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	ATP6V1A	P38606	617 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SYT6-204	ENST00000608879	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	ITPK1	Q13572	414 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	PHF14	O94880	888 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SYT6-204	ENST00000608879	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	SSFA2	P28290	1259 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	GNPAT	O15228	680 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	MSL1	Q68DK7	614 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	MRC1	P22897	1456 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SYT6-204	ENST00000608879	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.29	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
SYT6-204	ENST00000608879	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	TJP1	Q07157	1748 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	FCHSD2	O94868	740 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	ADRA2B	P18089	450 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	TEF	Q10587	303 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SYT6-204	ENST00000608879	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	UTRN	P46939	3433 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	RFC4	P35249	363 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	YY1	P25490	414 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	RALBP1	Q15311	655 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SYT6-204	ENST00000608879	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	GPR162	Q16538	588 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	MMP10	P09238	476 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	ZNF790	Q6PG37	636 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	NEFM	P07197	916 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	GYS1	P13807	737 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SYT6-204	ENST00000608879	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	BTBD11	A6QL63	1104 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	MCM10	Q7L590	875 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	STARD3NL	O95772	234 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	CHD4	Q14839	1912 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SYT6-204	ENST00000608879	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SYT6-204	ENST00000608879	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SYT6-204	ENST00000608879	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SYT6-204	ENST00000608879	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SYT6-204	ENST00000608879	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33	■■■□□ 2.87
SYT6-204	ENST00000608879	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.99	■■■□□ 2.87

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