RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TIMM50-216ENST00000601358 KLHL34Q8N239 644 aa28.46■■■□□ 2.15
TIMM50-216ENST00000601358 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
TIMM50-216ENST00000601358 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.46■■■□□ 2.15
TIMM50-216ENST00000601358 C4BP0C0L5 1744 aa28.45■■■□□ 2.15
TIMM50-216ENST00000601358 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.45■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.45■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 PHF14O94880 888 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 CFAP53Q96M91 514 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 ITPK1Q13572 414 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 MSL1Q68DK7 614 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 GNPATO15228 680 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 SMIM5Q71RC9 77 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-216ENST00000601358 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 LGR6Q9HBX8 967 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 SSFA2P28290 1259 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 PPP2R1AP30153 589 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 NUDCQ9Y266 331 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.34■■■□□ 2.13
TIMM50-216ENST00000601358 MAP3K5Q99683 1374 aa28.34■■■□□ 2.13
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TIMM50-216ENST00000601358 UTRNP46939 3433 aa28.32■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 YY1P25490 414 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 GPR162Q16538 588 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 PRKAR2BP31323 418 aa28.27■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.27■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.27■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 SLC39A6Q13433 755 aa28.27■■■□□ 2.12
TIMM50-216ENST00000601358 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.26■■■□□ 2.12
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TIMM50-216ENST00000601358 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 RPS6KA4O75676 772 aa28.25■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 RFC4P35249 363 aa28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 ADRA2BP18089 450 aa28.23■■■□□ 2.11
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TIMM50-216ENST00000601358 TEFQ10587 303 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.23■■■□□ 2.11
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TIMM50-216ENST00000601358 IL17REQ8NFR9 667 aa28.21■■■□□ 2.11
TIMM50-216ENST00000601358 MRC1P22897 1456 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 FCHSD2O94868 740 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 MMP10P09238 476 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
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TIMM50-216ENST00000601358 TJP1Q07157 1748 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-216ENST00000601358 NEFMP07197 916 aa28.15■■■□□ 2.1
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TIMM50-216ENST00000601358 CHD4Q14839 1912 aa28.12■■■□□ 2.09
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TIMM50-216ENST00000601358 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM50-216ENST00000601358 RALBP1Q15311 655 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-216ENST00000601358 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-216ENST00000601358 BTBD11A6QL63 1104 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM50-216ENST00000601358 GRIN3BO60391 1043 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM50-216ENST00000601358 STARD3NLO95772 234 aa28.09■■■□□ 2.09
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TIMM50-216ENST00000601358 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.099e-7■■■■□ 19.3
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TIMM50-216ENST00000601358 C4AP0C0L4 1744 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
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TIMM50-216ENST00000601358 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.05■■■□□ 2.08
TIMM50-216ENST00000601358 FKBP8Q14318 412 aa28.05■■■□□ 2.08
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