RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600000.1

TIMM44-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-211ENST00000600000 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 DCAF5Q96JK2 942 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 ATG3Q9NT62 314 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 HMOX1P09601 288 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 CABP4P57796 275 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-211ENST00000600000 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 ITPK1Q13572 414 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 KDRP35968 1356 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 GNPATO15228 680 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 MAP3K5Q99683 1374 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 GPR162Q16538 588 aa25.27■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.27■■□□□ 1.64
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.26■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 TJP1Q07157 1748 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 SSFA2P28290 1259 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 C4AP0C0L4 1744 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMM44-211ENST00000600000 UTRNP46939 3433 aa25.2■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 LGR6Q9HBX8 967 aa25.17■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 CFAP53Q96M91 514 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 MRC1P22897 1456 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.14■■□□□ 1.62
TIMM44-211ENST00000600000 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 SLC39A6Q13433 755 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 RFC4P35249 363 aa25.11■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 MMP10P09238 476 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.615e-8■□□□□ 9
TIMM44-211ENST00000600000 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 RPS6KA4O75676 772 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 PPP2R1AP30153 589 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM44-211ENST00000600000 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 ADRA2BP18089 450 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 PRKAR2BP31323 418 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 NUDCQ9Y266 331 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 TEFQ10587 303 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 GRIN3BO60391 1043 aa25.03■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.03■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 GYS1P13807 737 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM44-211ENST00000600000 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 DLG5Q8TDM6 1919 aa25■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 PHACTR3Q96KR7 559 aa25■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 PARP3Q9Y6F1 533 aa25■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 IL17REQ8NFR9 667 aa24.98■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 COL15A1P39059 1388 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 ZPR1O75312 459 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 FKBP8Q14318 412 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM44-211ENST00000600000 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TIMM44-211ENST00000600000 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TIMM44-211ENST00000600000 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TIMM44-211ENST00000600000 A0A0G2JLW4 131 aa24.93■■□□□ 1.58
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