RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.77■■□□□ 1.56
TIMM44-210ENST00000599939 MRE11P49959 708 aa24.77■■□□□ 1.56
TIMM44-210ENST00000599939 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.77■■□□□ 1.56
TIMM44-210ENST00000599939 NECTIN2Q92692 538 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 REC8O95072 547 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 LTN1O94822 1766 aa24.75■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ABTB2Q8N961 1025 aa24.75■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 PTMSP20962 102 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ERC2O15083 957 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 GNAI3P08754 354 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.73■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.72■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.72■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.71■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.71■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ATP8B2P98198 1209 aa24.71■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TIMM44-210ENST00000599939 ST18O60284 1047 aa24.7■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.7■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.69■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 MX1P20591 662 aa24.68■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.67■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 USP44Q9H0E7 712 aa24.67■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 NUCB2P80303 420 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 PKP1Q13835 747 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 NFAT5O94916 1531 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 C14orf37Q86TY3 774 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TIMM44-210ENST00000599939 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.63■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 STAP2Q9UGK3 403 aa24.63■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 IP6K1Q92551 441 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 CHMLP26374 656 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 NBPF4Q96M43 638 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 SSH3Q8TE77 659 aa24.6■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 MCTP1Q6DN14 999 aa24.59■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.59■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 RILPL2Q969X0 211 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 LGR6Q9HBX8 967 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM44-210ENST00000599939 NEK4P51957 841 aa24.58■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 PALD1Q9ULE6 856 aa24.58■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 AOX1Q06278 1338 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 POLA2Q14181 598 aa24.55■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.55■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 TMX3Q96JJ7 454 aa24.55■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 HOXB7P09629 217 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 MCCP23508 829 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 ANAPC15P60006 121 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 KCNQ3O43525 872 aa24.53■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 IL25Q9H293 177 aa24.53■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 RAB11FIP3O75154 756 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 IL17RAQ96F46 866 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-210ENST00000599939 MCM2P49736 904 aa24.51■■□□□ 1.51
TIMM44-210ENST00000599939 BEND3Q5T5X7 828 aa24.51■■□□□ 1.51
TIMM44-210ENST00000599939 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TIMM44-210ENST00000599939 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.5■■□□□ 1.51
TIMM44-210ENST00000599939 PSME1Q06323 249 aa24.5■■□□□ 1.51
TIMM44-210ENST00000599939 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms