RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599650.1

TIMM44-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-209ENST00000599650 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.16■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 RUNDC1Q96C34 613 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 SYT17Q9BSW7 474 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 ATG3Q9NT62 314 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM44-209ENST00000599650 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 SIK1P57059 783 aa18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 SMIM5Q71RC9 77 aa18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 DCAF5Q96JK2 942 aa18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.14■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 HMOX1P09601 288 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 POLD1P28340 1107 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 MSL1Q68DK7 614 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 KLHL34Q8N239 644 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 FCHSD2O94868 740 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 ITPK1Q13572 414 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 AK7Q96M32 723 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 KDRP35968 1356 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 PHF14O94880 888 aa18.11■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 ATP6V1AP38606 617 aa18.11■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 CABP4P57796 275 aa18.11■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 LY75O60449 1722 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM44-209ENST00000599650 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.08■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.07■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.07■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.07■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 GNPATO15228 680 aa18.06■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 APAF1O14727 1248 aa18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 YY1P25490 414 aa18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 CCDC27Q2M243 656 aa18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.05■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 MAP3K5Q99683 1374 aa18.04■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.04■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.04■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 LGR6Q9HBX8 967 aa18.04■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 SSFA2P28290 1259 aa18.03■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 PRKAR2BP31323 418 aa18.02■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.02■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.02■□□□□ 0.48
TIMM44-209ENST00000599650 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 C5P01031 1676 aa18.01■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 C4BP0C0L5 1744 aa18.01■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 ITGB4P16144 1822 aa18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 GOLGA2Q08379 1002 aa18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 GPR162Q16538 588 aa18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 UTRNP46939 3433 aa18■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 ZNF521Q96K83 1311 aa17.99■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 SLC39A6Q13433 755 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 WDR63Q8IWG1 891 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 E9PSI1 815 aa17.97■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 NFE2L2Q16236 605 aa17.97■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.97■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TIMM44-209ENST00000599650 RPS6KA4O75676 772 aa17.95■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 CRKLP46109 303 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 WWC1Q8IX03 1113 aa17.95■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.95■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 IL16Q14005 1332 aa17.95■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 MMP10P09238 476 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 RFC4P35249 363 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 RIPK4P57078 832 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 NEUROD2Q15784 382 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 IL17REQ8NFR9 667 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.92■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.469e-7■■□□□ 12.8
TIMM44-209ENST00000599650 ADRA2BP18089 450 aa17.92■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.92■□□□□ 0.46
TIMM44-209ENST00000599650 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms