RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-209ENST00000591387 ATP6V1AP38606 617 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-209ENST00000591387 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-209ENST00000591387 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.32■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.31■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.31■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 HMOX1P09601 288 aa24.3■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 SSFA2P28290 1259 aa24.3■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 ITPK1Q13572 414 aa24.3■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTIF-209ENST00000591387 CFAP53Q96M91 514 aa24.26■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 GNPATO15228 680 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 YY1P25490 414 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
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CTIF-209ENST00000591387 MSL1Q68DK7 614 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 KLHL34Q8N239 644 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.22■■□□□ 1.47
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CTIF-209ENST00000591387 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.22■■□□□ 1.47
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CTIF-209ENST00000591387 CHD4Q14839 1912 aa24.21■■□□□ 1.47
CTIF-209ENST00000591387 ADRA2BP18089 450 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 LGR6Q9HBX8 967 aa24.2■■□□□ 1.46
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CTIF-209ENST00000591387 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 MRC1P22897 1456 aa24.19■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.19■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.19■■□□□ 1.46
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CTIF-209ENST00000591387 PPP2R1AP30153 589 aa24.18■■□□□ 1.46
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CTIF-209ENST00000591387 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.18■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 GPR162Q16538 588 aa24.17■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-209ENST00000591387 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.14■■□□□ 1.45
CTIF-209ENST00000591387 TJP1Q07157 1748 aa24.13■■□□□ 1.45
CTIF-209ENST00000591387 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.13■■□□□ 1.45
CTIF-209ENST00000591387 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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CTIF-209ENST00000591387 TEFQ10587 303 aa24.08■■□□□ 1.45
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CTIF-209ENST00000591387 IL17REQ8NFR9 667 aa24.08■■□□□ 1.45
CTIF-209ENST00000591387 C4AP0C0L4 1744 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-209ENST00000591387 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-209ENST00000591387 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-209ENST00000591387 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTIF-209ENST00000591387 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-209ENST00000591387 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.07■■□□□ 1.44
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CTIF-209ENST00000591387 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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CTIF-209ENST00000591387 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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CTIF-209ENST00000591387 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 STARD3NLO95772 234 aa24■■□□□ 1.43
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CTIF-209ENST00000591387 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 ZPR1O75312 459 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 RALBP1Q15311 655 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.97■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.97■■□□□ 1.43
CTIF-209ENST00000591387 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.96■■□□□ 1.43
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