RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589931.1

TXNL1-210, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL1, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-210ENST00000589931 GTF2IP78347 998 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 PSME1Q06323 249 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 TRIM50Q86XT4 487 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.47□□□□□ -1.21
TXNL1-210ENST00000589931 SV2AQ7L0J3 742 aa7.46□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 SMTNP53814 917 aa7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 GMCL1Q96IK5 515 aa7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 PHKA2P46019 1235 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ATP1A2P50993 1020 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.44□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 A0A1B0GTH6 734 aa7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 H7C1W4 665 aa7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 BACH1O14867 736 aa7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 F11P03951 625 aa7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 C4orf17Q53FE4 359 aa7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 A6NJY4 79 aa7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CDK2AP1O14519 115 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CLDN10P78369 228 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 MTFR1Q15390 333 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 DBN1Q16643 649 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 OGFOD1Q8N543 542 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 GPAMQ9HCL2 828 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ZNF358Q9NW07 568 aa7.41□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 PLA2G4AP47712 749 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CCDC102BQ68D86 513 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 STK17AQ9UEE5 414 aa7.4□□□□□ -1.22
TXNL1-210ENST00000589931 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 KRT76Q01546 638 aa7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 PGBD3Q8N328 593 aa7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 ZMYND15Q9H091 742 aa7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 RASA1P20936 1047 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 MSX1P28360 303 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 SIX5Q8N196 739 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 CABP1Q9NZU7 370 aa7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 AIDAQ96BJ3 306 aa7.37□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 M0R2N6 131 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 GPR25O00155 361 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 EPHA4P54764 986 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 TNS4Q8IZW8 715 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 RUBCNLQ9H714 662 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 USP3Q9Y6I4 520 aa7.36□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 FOXK2Q01167 660 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 GAS6Q14393 721 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 EFHC2Q5JST6 749 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.35□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 ATP4AP20648 1035 aa7.34□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TXNL1-210ENST00000589931 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.9 ms