RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.57□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEFLP07196 543 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GOLGA2Q08379 1002 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MSH5O43196 834 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARXQ96QS3 562 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYT17Q9BSW7 474 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF521Q96K83 1311 aa9.55□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ITGB4P16144 1822 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KDRP35968 1356 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 E9PSI1 815 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR63Q8IWG1 891 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCAF5Q96JK2 942 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C5P01031 1676 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HMOX1P09601 288 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POLD1P28340 1107 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRKAR2BP31323 418 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SIK1P57059 783 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WWC1Q8IX03 1113 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATG3Q9NT62 314 aa9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C4BP0C0L5 1744 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP6V1AP38606 617 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMIM5Q71RC9 77 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KLHL34Q8N239 644 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AK7Q96M32 723 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHF14O94880 888 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CABP4P57796 275 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLFN5Q08AF3 891 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ITPK1Q13572 414 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEUROD2Q15784 382 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MSL1Q68DK7 614 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIPK4P57078 832 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NFE2L2Q16236 605 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IL16Q14005 1332 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAP3K5Q99683 1374 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GNPATO15228 680 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 YY1P25490 414 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SSFA2P28290 1259 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LGR6Q9HBX8 967 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GPR162Q16538 588 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms