RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585149.1

TSPOAP1-211, Transcript of TSPO associated protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1, Length 381 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-211ENST00000585149 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 BTBD11A6QL63 1104 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 BAG6P46379 1132 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 WWC1Q8IX03 1113 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 BTAF1O14981 1849 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 MRC1P22897 1456 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 PLSCR1O15162 318 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 WDR63Q8IWG1 891 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 GNAI1P63096 354 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 CFAP44Q96MT7 982 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 ATG3Q9NT62 314 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 IFT57Q9NWB7 429 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 IL16Q14005 1332 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 PALLDQ8WX93 1383 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 EP400Q96L91 3159 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLC39A6Q13433 755 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 CHL1O00533 1208 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 GOLGA2Q08379 1002 aa22.22■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 SIK1P57059 783 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSPOAP1-211ENST00000585149 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 ATP6V1AP38606 617 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 TXNRD1Q16881 649 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 SOCS7O14512 581 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF853P0CG23 659 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 PAPPAQ13219 1627 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 LY75O60449 1722 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF521Q96K83 1311 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPOAP1-211ENST00000585149 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.17■■□□□ 1.14
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TSPOAP1-211ENST00000585149 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 STARD3NLO95772 234 aa22.14■■□□□ 1.13
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 NBPF14Q5TI25 921 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 PROM2Q8N271 834 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 KCNQ4P56696 695 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLFN5Q08AF3 891 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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TSPOAP1-211ENST00000585149 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 HOXB7P09629 217 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 ITPK1Q13572 414 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 AK7Q96M32 723 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 STK32BQ9NY57 414 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPOAP1-211ENST00000585149 C5P01031 1676 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 RREB1Q92766 1687 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 USP16Q9Y5T5 823 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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