RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDCQ9Y266 331 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTRNP46939 3433 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 AK7Q96M32 723 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT17Q9BSW7 474 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP6V1AP38606 617 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRC1P22897 1456 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLD1P28340 1107 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARXQ96QS3 562 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSH5O43196 834 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSFA2P28290 1259 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITPK1Q13572 414 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K5Q99683 1374 aa22.88■■□□□ 1.25
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FCHSD2O94868 740 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 LGR6Q9HBX8 967 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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CCNDBP1-211ENST00000567434 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHD4Q14839 1912 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKAR2BP31323 418 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNPATO15228 680 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF14O94880 888 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADRA2BP18089 450 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEFQ10587 303 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TJP1Q07157 1748 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS6KA4O75676 772 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL17REQ8NFR9 667 aa22.77■■□□□ 1.24
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.76■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-211ENST00000567434 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.76■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.75■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC39A6Q13433 755 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR162Q16538 588 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.74■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RFC4P35249 363 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF790Q6PG37 636 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL34Q8N239 644 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4AP0C0L4 1744 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 STARD3NLO95772 234 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1QTNF8P60827 252 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTBD11A6QL63 1104 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GYS1P13807 737 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCM10Q7L590 875 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFE2L2Q16236 605 aa22.64■■□□□ 1.21
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