RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.6■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.6■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 AK7Q96M32 723 aa28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 PRKAR2BP31323 418 aa28.58■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.58■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.58■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
RNPS1-218ENST00000566180 FCHSD2O94868 740 aa28.56■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 RALBP1Q15311 655 aa28.56■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.56■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.55■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 C5P01031 1676 aa28.55■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 MSH5O43196 834 aa28.55■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.53■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.53■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 ARXQ96QS3 562 aa28.53■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 C4BP0C0L5 1744 aa28.52■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 MAP3K5Q99683 1374 aa28.52■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 MRC1P22897 1456 aa28.52■■■□□ 2.16
RNPS1-218ENST00000566180 SSFA2P28290 1259 aa28.51■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 POLD1P28340 1107 aa28.5■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 IL17REQ8NFR9 667 aa28.5■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.49■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 GNPATO15228 680 aa28.49■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.48■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 PHF14O94880 888 aa28.48■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 SMIM5Q71RC9 77 aa28.48■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.47■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.47■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 SLC39A6Q13433 755 aa28.46■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 SYT17Q9BSW7 474 aa28.46■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.45■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.45■■■□□ 2.15
RNPS1-218ENST00000566180 TEFQ10587 303 aa28.44■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 MSL1Q68DK7 614 aa28.44■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.43■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 RPS6KA4O75676 772 aa28.41■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 ADRA2BP18089 450 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-218ENST00000566180 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 NEFMP07197 916 aa28.38■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.38■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.38■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.37■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF790Q6PG37 636 aa28.36■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.36■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 MCM10Q7L590 875 aa28.35■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.34■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 KLHL34Q8N239 644 aa28.33■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
RNPS1-218ENST00000566180 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 BTBD11A6QL63 1104 aa28.32■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 RFC4P35249 363 aa28.32■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.32■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 DCTN1Q14203 1278 aa28.31■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 TJP1Q07157 1748 aa28.3■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 NFE2L2Q16236 605 aa28.3■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.29■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.29■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.28■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 KCNQ3O43525 872 aa28.28■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.28■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 GYS1P13807 737 aa28.27■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.27■■■□□ 2.12
RNPS1-218ENST00000566180 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 STARD3NLO95772 234 aa28.26■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.26■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.25■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 MMP10P09238 476 aa28.24■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
RNPS1-218ENST00000566180 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.23■■■□□ 2.11
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