RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 CYP27B1O15528 508 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 IL2RBP14784 551 aa22.52■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 RLBP1P12271 317 aa22.51■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 TRIM27P14373 513 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 COG6Q9Y2V7 657 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.49■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 BTBD11A6QL63 1104 aa22.49■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 MS4A1P11836 297 aa22.49■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.48■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 JCADQ9P266 1359 aa22.48■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 DCAF5Q96JK2 942 aa22.47■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.46■■□□□ 1.19
GDE1-203ENST00000564172 KCNQ3O43525 872 aa22.45■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.45■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.43■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.42■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.42■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.42■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.41■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SLC4A2P04920 1241 aa22.41■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 DISP2A7MBM2 1401 aa22.4■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.4■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SLIT2O94813 1529 aa22.4■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.39■■□□□ 1.18
GDE1-203ENST00000564172 HOXB7P09629 217 aa22.39■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 HSPA1LP34931 641 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 CABP4P57796 275 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 AAMPQ13685 434 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 ZNF790Q6PG37 636 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 STK31Q9BXU1 1019 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.38■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 MRC1P22897 1456 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 NRAPQ86VF7 1730 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SLC39A6Q13433 755 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 NECTIN2Q92692 538 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.36■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.36■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 PTPRCP08575 1304 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 NGLY1Q96IV0 654 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 C8orf37Q96NL8 207 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 ABCC4O15439 1325 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 G2E3Q7L622 706 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 FGD1P98174 961 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 EXOC5O00471 708 aa22.33■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
GDE1-203ENST00000564172 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 RGS12O14924 1447 aa22.31■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 LRP6O75581 1613 aa22.31■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.3■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.3■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.3■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 FLIIQ13045 1269 aa22.3■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.29■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.29■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 BARGINQ6ZT62 677 aa22.29■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.6 ms