RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		22.63	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	ARX	Q96QS3	562 aa		22.61	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		22.61	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	SSFA2	P28290	1259 aa		22.6	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		22.6	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	ATP8B2	P98198	1209 aa		22.6	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	NWD1	Q149M9	1564 aa		22.59	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	ABTB2	Q8N961	1025 aa		22.58	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		22.58	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		22.58	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		22.58	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		22.57	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	PANK2	Q9BZ23	570 aa		22.57	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		22.57	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	22.57	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		22.57	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	22.56	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA6	P17658	529 aa		22.56	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		22.56	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	MX1	P20591	662 aa		22.55	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	22.54	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	MCC	P23508	829 aa		22.54	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	MCM2	P49736	904 aa		22.54	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	STAP2	Q9UGK3	403 aa		22.54	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	AOX1	Q06278	1338 aa		22.53	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		22.52	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		22.52	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	22.52	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		22.52	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC15	P60006	121 aa		22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	22.51	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB7	P09629	217 aa		22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	IP6K1	Q92551	441 aa		22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	NECTIN2	Q92692	538 aa		22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	USP44	Q9H0E7	712 aa		22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		22.5	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		22.49	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		22.49	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	RAB11FIP3	O75154	756 aa		22.49	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	SSH3	Q8TE77	659 aa		22.48	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		22.48	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	AK9	Q5TCS8	1911 aa		22.47	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		22.47	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	CHML	P26374	656 aa		22.47	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	MCTP1	Q6DN14	999 aa		22.47	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf37	Q86TY3	774 aa		22.47	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	NEK4	P51957	841 aa		22.46	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	LTN1	O94822	1766 aa		22.46	■■□□□ 1.19
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		22.45	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	RILPL2	Q969X0	211 aa		22.45	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	IL17RA	Q96F46	866 aa		22.45	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN1	P35523	988 aa		22.45	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		22.44	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	22.44	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	22.44	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	POLA2	Q14181	598 aa		22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	22.43	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	NFAT5	O94916	1531 aa		22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF445	P59923	1031 aa		22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	TMX3	Q96JJ7	454 aa		22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	22.42	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	PKP1	Q13835	747 aa		22.41	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		22.41	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		22.41	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	22.41	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	CUL4A	Q13619	759 aa		22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF4	Q96M43	638 aa		22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		22.4	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		22.39	■■□□□ 1.18
RRN3-205	ENST00000563559	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		22.39	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	22.39	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PSME1	Q06323	249 aa		22.39	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	TEF	Q10587	303 aa		22.39	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.17

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