RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-206ENST00000561407 POU4F2Q12837 409 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-206ENST00000561407 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-206ENST00000561407 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-206ENST00000561407 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-206ENST00000561407 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-206ENST00000561407 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD2-206ENST00000561407 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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TMOD2-206ENST00000561407 NBPF15Q8N660 670 aa6.71□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD2-206ENST00000561407 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
TMOD2-206ENST00000561407 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD2-206ENST00000561407 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 A6NJY4 79 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD2-206ENST00000561407 MTFR1Q15390 333 aa6.66□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 H7C1W4 665 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD2-206ENST00000561407 PTK7Q13308 1070 aa6.65□□□□□ -1.34
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TMOD2-206ENST00000561407 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-206ENST00000561407 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-206ENST00000561407 USP17L15C9J2P7 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-206ENST00000561407 USP17L10C9JJH3 530 aa6.62□□□□□ -1.35
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