RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD109Q6YHK3 1445 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 LILRA1O75019 489 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 SKIP12755 728 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLGA3Q08378 1498 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP9BO43861 1147 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVK-9P63128 1117 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYLDQ9NQC7 956 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZNB5 142 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 AXIN1O15169 862 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCTRP47872 440 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 MADDQ8WXG6 1647 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP17L5A8MUK1 530 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZVU0 165 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 AAASQ9NRG9 546 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD9Q5K651 1589 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPRMP28827 1452 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP4Q13107 963 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBLBQ13191 982 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRXQ9BXM0 1461 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 ST8SIA5O15466 376 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP17L3A6NCW0 530 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP17L4A6NCW7 530 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCOA4Q13772 614 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEIOBQ8N635 442 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIRT1Q96EB6 747 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE2BO14633 110 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 RICTORQ6R327 1708 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 EML3Q32P44 896 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 NEO1Q92859 1461 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADH1AP07327 375 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP10BO94823 1461 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO41Q8TF61 875 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOD1Q9Y239 953 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 DACH1Q9UI36 760 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 BMP1P13497 986 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPP2O95045 317 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 RELBQ01201 579 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGIRP43119 386 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 GTF2IP78347 998 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM50Q86XT4 487 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNRH1P01148 92 aa14.42□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 RFX1P22670 979 aa14.42□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCARF1Q14162 830 aa14.42□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPINT1O43278 529 aa14.41□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 BMP2P12643 396 aa14.41□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.41□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.41□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.4□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP1A2P50993 1020 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms