RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559277.1

TMC3-AS1-202, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 479 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.64■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.64■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AMPHP49418 695 aa16.63■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.62■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.62■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FOXN1O15353 648 aa16.61■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.61■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.61■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TMF1P82094 1093 aa16.6■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POTECB2RU33 542 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GYS1P13807 737 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ATP6V1AP38606 617 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FAM161AQ3B820 660 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PIM2Q9P1W9 311 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.58■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RTL1A6NKG5 1358 aa16.58■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.58■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RASSF7Q02833 373 aa16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KDRP35968 1356 aa16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CHRNA5P30532 468 aa16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 COG3Q96JB2 828 aa16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GLTPD2A6NH11 291 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ATG3Q9NT62 314 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.54■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.53■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DDR1Q08345 913 aa16.53■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 INSRP06213 1382 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CREBZFQ9NS37 354 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NCAPD2Q15021 1401 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABHD8Q96I13 439 aa16.5■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POTEIP0CG38 1075 aa16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POTEJP0CG39 1038 aa16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FKBP8Q14318 412 aa16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CNTNAP1P78357 1384 aa16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RPS6KA4O75676 772 aa16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADRA2BP18089 450 aa16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RFC4P35249 363 aa16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LBX1P52954 281 aa16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FYB1O15117 783 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LMNB1P20700 586 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.46■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PHKG2P15735 406 aa16.45■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FLT4P35916 1363 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NFKBIEO00221 500 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TM4SF1P30408 202 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 VEGFBP49765 207 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RGS19P49795 217 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WBP1LQ9NX94 342 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CHADLQ6NUI6 762 aa16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SPG7Q9UQ90 795 aa16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PASKQ96RG2 1323 aa16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.42■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TONSLQ96HA7 1378 aa16.41■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.41■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TJP1Q07157 1748 aa16.41■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.4■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.4■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TESK2Q96S53 571 aa16.4■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.4■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms