RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.24■■□□□ 1.15
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USP3-AS1-201ENST00000558831 BCAR3O75815 825 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLIN1O60240 522 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPYL6Q8N831 410 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-201ENST00000558831 CABP4P57796 275 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTBD11A6QL63 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 VAMP4O75379 141 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRC1P22897 1456 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT24Q2M2I5 525 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF428Q96B54 188 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 RXRBP28702 533 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNQ3O43525 872 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF790Q6PG37 636 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGB4P16144 1822 aa22.08■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC39A6Q13433 755 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 POTEAQ6S8J7 498 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF16BQ96L93 1317 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRBNQ96SW2 442 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL9O00512 1426 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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USP3-AS1-201ENST00000558831 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE3AQ14432 1141 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NECTIN2Q92692 538 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM182BQ5T319 152 aa22.02■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.02■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.02■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 STK31Q9BXU1 1019 aa22.02■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXB7P09629 217 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP3-AS1-201ENST00000558831 PANK1Q8TE04 598 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAPPAQ13219 1627 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MS4A1P11836 297 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHMP4AQ9BY43 222 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP4R2Q9NY27 417 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNNQ9UQP3 1299 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC4A2P04920 1241 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGS12O14924 1447 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM27P14373 513 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATG3Q9NT62 314 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNQ2O43526 872 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 COG6Q9Y2V7 657 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 NHSQ6T4R5 1651 aa21.96■■□□□ 1.11
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