RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 SSFA2P28290 1259 aa27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 ATP6V1AP38606 617 aa27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 SMIM5Q71RC9 77 aa27.36■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 KDRP35968 1356 aa27.35■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.34■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.34■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 PHF14O94880 888 aa27.33■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.33■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.33■■□□□ 1.97
MFGE8-208ENST00000558773 GNPATO15228 680 aa27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 MTHFSP49914 203 aa27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 CABP4P57796 275 aa27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.28■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
MFGE8-208ENST00000558773 GRIN3BO60391 1043 aa27.26■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.25■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.22■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.22■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.22■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.22■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.21■■□□□ 1.95
MFGE8-208ENST00000558773 RPS6KA4O75676 772 aa27.2■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 ADRA2BP18089 450 aa27.2■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 HMOX1P09601 288 aa27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.17■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 LGR6Q9HBX8 967 aa27.17■■□□□ 1.94
MFGE8-208ENST00000558773 MMP10P09238 476 aa27.16■■□□□ 1.94
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MFGE8-208ENST00000558773 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.15■■□□□ 1.94
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MFGE8-208ENST00000558773 GYS1P13807 737 aa27.13■■□□□ 1.93
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MFGE8-208ENST00000558773 TJP1Q07157 1748 aa27.13■■□□□ 1.93
MFGE8-208ENST00000558773 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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MFGE8-208ENST00000558773 MRC1P22897 1456 aa27.12■■□□□ 1.93
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MFGE8-208ENST00000558773 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.1■■□□□ 1.93
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MFGE8-208ENST00000558773 SLC39A6Q13433 755 aa27.05■■□□□ 1.92
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MFGE8-208ENST00000558773 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.03■■□□□ 1.92
MFGE8-208ENST00000558773 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
MFGE8-208ENST00000558773 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.03■■□□□ 1.92
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MFGE8-208ENST00000558773 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.01■■□□□ 1.91
MFGE8-208ENST00000558773 ATP10DQ9P241 1426 aa27■■□□□ 1.91
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MFGE8-208ENST00000558773 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.94■■□□□ 1.9
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MFGE8-208ENST00000558773 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.93■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.93■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 NARFQ9UHQ1 456 aa26.93■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 BCS1LQ9Y276 419 aa26.93■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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