RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.96□□□□□ -0.65
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHL1O00533 1208 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYP27B1O15528 508 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DDB1Q16531 1140 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LGR6Q9HBX8 967 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRC37A3O60309 1634 aa10.95□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BAG6P46379 1132 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MBIPQ9NS73 344 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TNS2Q63HR2 1409 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CABP4P57796 275 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF428Q96B54 188 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EP400Q96L91 3159 aa10.91□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BTBD11A6QL63 1104 aa10.91□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.91□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM182BQ5T319 152 aa10.9□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.9□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRP5O75197 1615 aa10.9□□□□□ -0.66
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MRC1P22897 1456 aa10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RREB1Q92766 1687 aa10.89□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VAMP4O75379 141 aa10.88□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ITGB4P16144 1822 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SBF2Q86WG5 1849 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HOXB7P09629 217 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF790Q6PG37 636 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM37O94972 964 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEFLP07196 543 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSPYL6Q8N831 410 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CACNA1FO60840 1977 aa10.85□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DOT1LQ8TEK3 1739 aa10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BCL9O00512 1426 aa10.84□□□□□ -0.67
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNQ3O43525 872 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 APBA3O96018 575 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNA4P22459 653 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC39A6Q13433 755 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIGBQ92521 554 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BCAR3O75815 825 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MS4A1P11836 297 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KRT24Q2M2I5 525 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STK31Q9BXU1 1019 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAPPAQ13219 1627 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF16BQ96L93 1317 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.81□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms