RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.04■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 C4BP0C0L5 1744 aa28.02■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 SMIM5Q71RC9 77 aa28.01■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.01■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 PRKAR2BP31323 418 aa28■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 ATP6V1AP38606 617 aa28■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 SCN11AQ9UI33 1791 aa28■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 MRC1P22897 1456 aa28■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.99■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 NUDCQ9Y266 331 aa27.99■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.99■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.98■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 AK7Q96M32 723 aa27.96■■■□□ 2.07
CS-226ENST00000551430 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.95■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 MAP3K5Q99683 1374 aa27.95■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 MSH5O43196 834 aa27.93■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 RALBP1Q15311 655 aa27.93■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 IL17REQ8NFR9 667 aa27.93■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 FCHSD2O94868 740 aa27.92■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.92■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 PHF14O94880 888 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 SLC39A6Q13433 755 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 ARXQ96QS3 562 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 GNPATO15228 680 aa27.9■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 MSL1Q68DK7 614 aa27.9■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.89■■■□□ 2.06
CS-226ENST00000551430 SSFA2P28290 1259 aa27.88■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.87■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.87■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.86■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 SYT17Q9BSW7 474 aa27.85■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 TJP1Q07157 1748 aa27.84■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 POLD1P28340 1107 aa27.84■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.83■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CS-226ENST00000551430 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.82■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 UTRNP46939 3433 aa27.82■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 TEFQ10587 303 aa27.8■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 RPS6KA4O75676 772 aa27.79■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 MCM10Q7L590 875 aa27.79■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 DCTN1Q14203 1278 aa27.78■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.77■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CS-226ENST00000551430 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.76■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 ZNF790Q6PG37 636 aa27.76■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 KCNQ3O43525 872 aa27.75■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 ADRA2BP18089 450 aa27.74■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 KLHL34Q8N239 644 aa27.74■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.73■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.73■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.73■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.73■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 BTBD11A6QL63 1104 aa27.71■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 NFE2L2Q16236 605 aa27.71■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.71■■■□□ 2.03
CS-226ENST00000551430 GYS1P13807 737 aa27.7■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.7■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 C4AP0C0L4 1744 aa27.69■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 RFC4P35249 363 aa27.68■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 NEFMP07197 916 aa27.67■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.67■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 MMP10P09238 476 aa27.66■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.66■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CS-226ENST00000551430 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.63■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms