RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CS-222	ENST00000550996	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CS-222	ENST00000550996	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CS-222	ENST00000550996	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CS-222	ENST00000550996	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	PRKAR2B	P31323	418 aa		28	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	ATP6V1A	P38606	617 aa		28	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	MRC1	P22897	1456 aa		28	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	NUDC	Q9Y266	331 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.98	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	AK7	Q96M32	723 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CS-222	ENST00000550996	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	MSH5	O43196	834 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	RALBP1	Q15311	655 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	FCHSD2	O94868	740 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	PHF14	O94880	888 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	SLC39A6	Q13433	755 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	ARX	Q96QS3	562 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	GNPAT	O15228	680 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	MSL1	Q68DK7	614 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CS-222	ENST00000550996	SSFA2	P28290	1259 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	SYT17	Q9BSW7	474 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	TJP1	Q07157	1748 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	POLD1	P28340	1107 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CS-222	ENST00000550996	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	UTRN	P46939	3433 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	TEF	Q10587	303 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	RPS6KA4	O75676	772 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	MCM10	Q7L590	875 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CS-222	ENST00000550996	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	KCNQ3	O43525	872 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	ADRA2B	P18089	450 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	KLHL34	Q8N239	644 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CS-222	ENST00000550996	GYS1	P13807	737 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	C4A	P0C0L4	1744 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	RFC4	P35249	363 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	NEFM	P07197	916 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	MMP10	P09238	476 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CS-222	ENST00000550996	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CS-222	ENST00000550996	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		27.63	■■■□□ 2.01

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