RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TMC1Q8TDI8 760 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 MAP3K5Q99683 1374 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 GCP02774 474 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 NLRP13Q86W25 1043 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 BCL9O00512 1426 aa13.46□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 PAPPAQ13219 1627 aa13.46□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 TMF1P82094 1093 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 NHSQ6T4R5 1651 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 COL18A1P39060 1754 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 SLIT3O75094 1523 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 RGPD5Q99666 1765 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 NLRP6P59044 892 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 SPOCK2Q92563 424 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 USP6P35125 1406 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 ZNF827Q17R98 1081 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 ACSBG1Q96GR2 724 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 BTAF1O14981 1849 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-217ENST00000550044 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 TNS2Q63HR2 1409 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 PIK3C2AO00443 1686 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 ATP10DQ9P241 1426 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 EXOC5O00471 708 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 POLD1P28340 1107 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 CDCA8Q53HL2 280 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 GPR153Q6NV75 609 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 MICALL2Q8IY33 904 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 ABCC6O95255 1503 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 SOX12O15370 315 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.276e-10■□□□□ 9.4
CS-217ENST00000550044 NME9Q86XW9 330 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PP64 1363 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 HSPA6P17066 643 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 CCDC7Q96M83 1385 aa13.33□□□□□ -0.27
CS-217ENST00000550044 GRIN3BO60391 1043 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 ARSIQ5FYB1 569 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 NFAT5O94916 1531 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 USP31Q70CQ4 1352 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 FYB1O15117 783 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 FBLN1P23142 703 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 KCNQ4P56696 695 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-217ENST00000550044 COG3Q96JB2 828 aa13.28□□□□□ -0.28
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CS-217ENST00000550044 ADCY9O60503 1353 aa13.28□□□□□ -0.28
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CS-217ENST00000550044 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 PANK3Q9H999 370 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 IL2RBP14784 551 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 MSL1Q68DK7 614 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 LTN1O94822 1766 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 LY75O60449 1722 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
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