RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 BCS1LQ9Y276 419 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 HTRA3P83110 453 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 FSTL1Q12841 308 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CDCA8Q53HL2 280 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP27B1O15528 508 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP10P09238 476 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 PIGBQ92521 554 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A0G2JLW4 131 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 SIK1P57059 783 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 GNPATO15228 680 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 PCNTO95613 3336 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 FCHSD2O94868 740 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP2-204ENST00000548823 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 INSRP06213 1382 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DPEP1P16444 411 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ITPK1Q13572 414 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP6V1AP38606 617 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 RALBP1Q15311 655 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.83■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 RRAGCQ9HB90 399 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FYB1O15117 783 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FLT4P35916 1363 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 C4AP0C0L4 1744 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNA3P22001 575 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SPG7Q9UQ90 795 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PIM2Q9P1W9 311 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF5Q96JK2 942 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF181Q9P0P0 153 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ADRA2BP18089 450 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PANK3Q9H999 370 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 MRS2Q9HD23 443 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 GYS1P13807 737 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ATG3Q9NT62 314 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC184Q52MB2 194 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NCAPD2Q15021 1401 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SBF1O95248 1867 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RFC4P35249 363 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 KDRP35968 1356 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RPS6KA4O75676 772 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PHKG2P15735 406 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-204ENST00000548823 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GLTPD2A6NH11 291 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 EYA1Q99502 592 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRNA5P30532 468 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC34A2O95436 690 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms