RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 KDRP35968 1356 aa22.8■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 SSFA2P28290 1259 aa22.8■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.8■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 PHF14O94880 888 aa22.79■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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CASP9-211ENST00000546969 GPR162Q16538 588 aa22.78■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.78■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 MSL1Q68DK7 614 aa22.78■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 CFAP53Q96M91 514 aa22.78■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 GNPATO15228 680 aa22.77■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 HMOX1P09601 288 aa22.77■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.77■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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CASP9-211ENST00000546969 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 ITPK1Q13572 414 aa22.74■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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CASP9-211ENST00000546969 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 NUDCQ9Y266 331 aa22.72■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.71■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CASP9-211ENST00000546969 ADRA2BP18089 450 aa22.7■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.7■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.68■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.68■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.68■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.67■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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CASP9-211ENST00000546969 RFC4P35249 363 aa22.67■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 RPS6KA4O75676 772 aa22.66■■□□□ 1.22
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CASP9-211ENST00000546969 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.66■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.65■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.65■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.64■■□□□ 1.22
CASP9-211ENST00000546969 SMIM5Q71RC9 77 aa22.64■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.64■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.64■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 LGR6Q9HBX8 967 aa22.64■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 CHD4Q14839 1912 aa22.63■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 TEFQ10587 303 aa22.63■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.62■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.62■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 NEFMP07197 916 aa22.6■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 MMP10P09238 476 aa22.6■■□□□ 1.21
CASP9-211ENST00000546969 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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CASP9-211ENST00000546969 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
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CASP9-211ENST00000546969 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.57■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 ZPR1O75312 459 aa22.56■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.56■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.56■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 MRC1P22897 1456 aa22.55■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 FCHSD2O94868 740 aa22.55■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 STARD3NLO95772 234 aa22.55■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 GYS1P13807 737 aa22.54■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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CASP9-211ENST00000546969 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.53■■□□□ 1.2
CASP9-211ENST00000546969 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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CASP9-211ENST00000546969 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CASP9-211ENST00000546969 TGFB2P61812 414 aa22.51■■□□□ 1.19
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CASP9-211ENST00000546969 IL17REQ8NFR9 667 aa22.51■■□□□ 1.19
CASP9-211ENST00000546969 ZNF790Q6PG37 636 aa22.5■■□□□ 1.19
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CASP9-211ENST00000546969 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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CASP9-211ENST00000546969 A0A087WZG4 1122 aa22.48■■□□□ 1.19
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CASP9-211ENST00000546969 FKBP8Q14318 412 aa22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 NARFQ9UHQ1 456 aa22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.45■■□□□ 1.18
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