RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542776.5

POP5-208, Transcript of POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 2

Gene POP5, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP5-208	ENST00000542776	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.27	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	AK7	Q96M32	723 aa		13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.26	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.25	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	CABP4	P57796	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.25	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	GNPAT	O15228	680 aa		13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	TJP1	Q07157	1748 aa		13.23	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.23	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.22	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	POLD1	P28340	1107 aa		13.22	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.22	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.22	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	YY1	P25490	414 aa		13.21	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.21	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
POP5-208	ENST00000542776	MRC1	P22897	1456 aa		13.21	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.21	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.2	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.2	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.19	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.19	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	SSFA2	P28290	1259 aa		13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.18	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.17	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.17	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	GPR162	Q16538	588 aa		13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
POP5-208	ENST00000542776	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.15	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	UTRN	P46939	3433 aa		13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	MMP10	P09238	476 aa		13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	KCNQ3	O43525	872 aa		13.13	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	GYS1	P13807	737 aa		13.13	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.13	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.13	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.13	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CHD4	Q14839	1912 aa		13.12	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.12	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	MCM10	Q7L590	875 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	RFC4	P35249	363 aa		13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	FKBP8	Q14318	412 aa		13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	DDR1	Q08345	913 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
POP5-208	ENST00000542776	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POP5-208	ENST00000542776	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POP5-208	ENST00000542776	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
POP5-208	ENST00000542776	TEF	Q10587	303 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POP5-208	ENST00000542776	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POP5-208	ENST00000542776	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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