RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 POLD1P28340 1107 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 MSH5O43196 834 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 ITPK1Q13572 414 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 ARXQ96QS3 562 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 MRC1P22897 1456 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 SSFA2P28290 1259 aa22.28■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K5Q99683 1374 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 LGR6Q9HBX8 967 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-209ENST00000533069 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 PRKAR2BP31323 418 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 GNPATO15228 680 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 FCHSD2O94868 740 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 PHF14O94880 888 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 RALBP1Q15311 655 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 SYT17Q9BSW7 474 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PKP3-209ENST00000533069 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 MSL1Q68DK7 614 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 ADRA2BP18089 450 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 TEFQ10587 303 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 RPS6KA4O75676 772 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 IL17REQ8NFR9 667 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 SLC39A6Q13433 755 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 SMIM5Q71RC9 77 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 NEFMP07197 916 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 KLHL34Q8N239 644 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 TJP1Q07157 1748 aa22.14■■□□□ 1.14
PKP3-209ENST00000533069 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 RFC4P35249 363 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 ZNF790Q6PG37 636 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-209ENST00000533069 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 BTBD11A6QL63 1104 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 MCM10Q7L590 875 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 STARD3NLO95772 234 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 MMP10P09238 476 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 GYS1P13807 737 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 NFE2L2Q16236 605 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 GPR162Q16538 588 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 C4AP0C0L4 1744 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 COL15A1P39059 1388 aa22.02■■□□□ 1.12
PKP3-209ENST00000533069 DCTN1Q14203 1278 aa22.02■■□□□ 1.12
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