RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ST5P78524 1137 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.143e-8■■■□□ 16.7
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ERBB3P21860 1342 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 EFCC1Q9HA90 598 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 POLKQ9UBT6 870 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 APPP05067 770 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CCDC192P0DO97 292 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 MYO1CO00159 1063 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 AFAP1Q8N556 730 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PREX2Q70Z35 1606 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PTPN14Q15678 1187 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 DCTPP1Q9H773 170 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PLA2G4AP47712 749 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 GPATCH11Q8N954 259 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 SMARCE1Q969G3 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 MADDQ8WXG6 1647 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 MED14O60244 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 SIRT1Q96EB6 747 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 CFAP44Q96MT7 982 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 CLCN6P51797 869 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ERO1AQ96HE7 468 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 MCM2P49736 904 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 CBX8Q9HC52 389 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PSEN1P49768 467 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 ZNF75DP51815 510 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 TYRO3Q06418 890 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 GORABQ5T7V8 394 aa22.09■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 KRT24Q2M2I5 525 aa22.09■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 PTPRCP08575 1304 aa22.08■■□□□ 1.13
PACS1-205ENST00000527224 STX6O43752 255 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN26Q16670 478 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 YY1AP1Q9H869 796 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 VAMP4O75379 141 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 CASQ1P31415 396 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 DRC1Q96MC2 740 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 ICE2Q659A1 982 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 CLTCL1P53675 1640 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 F13A1P00488 732 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 TEX35Q5T0J7 233 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 RILPL2Q969X0 211 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 LIG1P18858 919 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 SKILP12757 684 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 PTPRTO14522 1441 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 MCCP23508 829 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 MAP3K11Q16584 847 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 RAD50Q92878 1312 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 ABCC4O15439 1325 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-205ENST00000527224 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.03■■□□□ 1.12
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