RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 SIK1P57059 783 aa19.62■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC184Q52MB2 194 aa19.62■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.62■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 FCHSD2O94868 740 aa19.61■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.61■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 MRS2Q9HD23 443 aa19.61■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.61■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 ITGB4P16144 1822 aa19.6■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 MIER1Q8N108 512 aa19.6■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 MAP3K5Q99683 1374 aa19.59■□□□□ 0.73
BRMS1-204ENST00000525127 CABP4P57796 275 aa19.59■□□□□ 0.73
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BRMS1-204ENST00000525127 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.72
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BRMS1-204ENST00000525127 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.55■□□□□ 0.72
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BRMS1-204ENST00000525127 PHF14O94880 888 aa19.54■□□□□ 0.72
BRMS1-204ENST00000525127 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.54■□□□□ 0.72
BRMS1-204ENST00000525127 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.54■□□□□ 0.72
BRMS1-204ENST00000525127 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
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BRMS1-204ENST00000525127 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.53■□□□□ 0.72
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BRMS1-204ENST00000525127 ITPK1Q13572 414 aa19.52■□□□□ 0.72
BRMS1-204ENST00000525127 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.52■□□□□ 0.72
BRMS1-204ENST00000525127 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.51■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 GPR162Q16538 588 aa19.5■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.49■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.49■□□□□ 0.71
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BRMS1-204ENST00000525127 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.48■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 RUNDC1Q96C34 613 aa19.48■□□□□ 0.71
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BRMS1-204ENST00000525127 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.47■□□□□ 0.71
BRMS1-204ENST00000525127 ADRA2BP18089 450 aa19.46■□□□□ 0.71
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BRMS1-204ENST00000525127 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.46■□□□□ 0.71
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BRMS1-204ENST00000525127 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.45■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.44■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.44■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 LGR6Q9HBX8 967 aa19.44■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.43■□□□□ 0.7
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BRMS1-204ENST00000525127 NFE2L2Q16236 605 aa19.43■□□□□ 0.7
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BRMS1-204ENST00000525127 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.43■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 RFC4P35249 363 aa19.42■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.42■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 GRIN3BO60391 1043 aa19.41■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.41■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.4■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.4■□□□□ 0.7
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BRMS1-204ENST00000525127 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
BRMS1-204ENST00000525127 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.39■□□□□ 0.7
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BRMS1-204ENST00000525127 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.38■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.37■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 APAF1O14727 1248 aa19.37■□□□□ 0.69
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BRMS1-204ENST00000525127 NGEFQ8N5V2 710 aa19.37■□□□□ 0.69
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BRMS1-204ENST00000525127 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.36■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.35■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.35■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 GYS1P13807 737 aa19.34■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC27Q2M243 656 aa19.34■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 IL17REQ8NFR9 667 aa19.34■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
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