RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 IFT140Q96RY7 1462 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 H7C1W4 665 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 POU4F2Q12837 409 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 CLN3Q13286 438 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 KANK3Q6NY19 840 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.47□□□□□ -1.21
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HDAC2-216ENST00000523628 TRAK2O60296 914 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 GPR37L1O60883 481 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SCTRP47872 440 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.47□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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HDAC2-216ENST00000523628 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 IGF1RP08069 1367 aa7.46□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 COG6Q9Y2V7 657 aa7.45□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 A6NJR5 290 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 APBB1O00213 710 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 IGHA1P01876 353 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 FOXK2Q01167 660 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 BCRP11274 1271 aa7.42□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.42□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.42□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 ACDQ96AP0 544 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 TOPBP1Q92547 1522 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 IL2RAP01589 272 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 CENPCQ03188 943 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC2-216ENST00000523628 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.4□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.4□□□□□ -1.22
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HDAC2-216ENST00000523628 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 XAGE2Q96GT9 111 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC2-216ENST00000523628 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 MAP2K3P46734 347 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 PODNQ7Z5L7 613 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GTH6 734 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 OIP5O43482 229 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 PHKA2P46019 1235 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 PHF24Q9UPV7 400 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 USP4Q13107 963 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf17Q53FE4 359 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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