RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNRKQ9NRH2 765 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 MSTNO14793 375 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADAM23O75077 832 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAP2K3P46734 347 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 NEUROD2Q15784 382 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLRG1Q96E93 195 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 A0A1B0GTH6 734 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHKA2P46019 1235 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 PODNQ7Z5L7 613 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRBA1A5PL33 1030 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 C4orf17Q53FE4 359 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 GPAMQ9HCL2 828 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 C2CD2LO14523 706 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 COL8A1P27658 744 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 MSX1P28360 303 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 IRF5Q13568 498 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 RUBCNLQ9H714 662 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 BNIP3LO60238 219 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 GNASQ5JWF2 1037 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 XP32Q5T750 250 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 HCN2Q9UL51 889 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHF24Q9UPV7 400 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 SCNN1DP51172 638 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 CTBSQ01459 385 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-988P-201ENST00000519081 USP4Q13107 963 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 APBB1O00213 710 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 FGFR3P22607 806 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 BAG6P46379 1132 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 EFHC2Q5JST6 749 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 PGBD3Q8N328 593 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 GGA1Q9UJY5 639 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 BMP4P12644 408 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATP4AP20648 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 BTBD6Q96KE9 485 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 INHAP05111 366 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 EPXP11678 715 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 TLR1Q15399 786 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF135Q8IUD6 432 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLF15Q9UIH9 416 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 ARAFP10398 606 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 DGKGP49619 791 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 RRAGCQ9HB90 399 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLA2G4AP47712 749 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 GDF10P55107 478 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 NLRP8Q86W28 1048 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-988P-201ENST00000519081 GNB5O14775 395 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SMTNP53814 917 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TNP2Q05952 138 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 VAC14Q08AM6 782 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms