RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514131.1

CSNK1G3-208, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, human

TSL 5

Gene CSNK1G3, Length 253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1G3-208	ENST00000514131	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SMTN	P53814	917 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	NBPF15	Q8N660	670 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TREML4	Q6UXN2	200 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131		H3BM21	787 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	WFS1	O76024	890 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	BACH1	O14867	736 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PHKA2	P46019	1235 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131		A6NJY4	79 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SIX5	Q8N196	739 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	DKK1	O94907	266 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PTK7	Q13308	1070 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TNS4	Q8IZW8	715 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ITGA6	P23229	1130 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	MTFR1	Q15390	333 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP3	Q9Y6I4	520 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L15	C9J2P7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L10	C9JJH3	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L12	C9JPN9	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L11	C9JVI0	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L21	D6R901	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L18	D6R9N7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L22	D6RA61	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	LCE2C	Q5TA81	110 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	DPYD	Q12882	1025 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	IRF7	Q92985	503 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	EPHA4	P54764	986 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SEC13	P55735	322 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	FOXK2	Q01167	660 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CABP1	Q9NZU7	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSNK1G3-208	ENST00000514131	CDC14C	A4D256	554 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131		M0R2N6	131 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	F11	P03951	625 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131		A0A1B0GTH6	734 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	ARX	Q96QS3	562 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	LGR5	O75473	907 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CSNK1G3-208	ENST00000514131	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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