RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MMP10P09238 476 aa28.1■■■□□ 2.09
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 EYA1Q99502 592 aa28.09■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATG3Q9NT62 314 aa28.09■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.09■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHKG2P15735 406 aa28.08■■■□□ 2.09
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.68■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GLTPD2A6NH11 291 aa27.66■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.66■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.65■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.65■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.65■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMNB1P20700 586 aa27.63■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NARFQ9UHQ1 456 aa27.63■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.63■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZPR1O75312 459 aa27.62■■■□□ 2.01
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