RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 SIK1P57059 783 aa22.21■■□□□ 1.15
ALYREF-204ENST00000512673 KCNA3P22001 575 aa22.2■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.19■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.19■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.18■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 COG3Q96JB2 828 aa22.17■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 C4AP0C0L4 1744 aa22.17■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 ATP6V1AP38606 617 aa22.16■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 TMF1P82094 1093 aa22.16■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 DCAF5Q96JK2 942 aa22.16■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.15■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.15■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 SBF1O95248 1867 aa22.15■■□□□ 1.14
ALYREF-204ENST00000512673 PIM2Q9P1W9 311 aa22.14■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 RASSF7Q02833 373 aa22.13■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 FAM161AQ3B820 660 aa22.13■■□□□ 1.13
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ALYREF-204ENST00000512673 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.13■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 FOXN1O15353 648 aa22.12■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.12■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.12■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 CHRNA5P30532 468 aa22.11■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 GYS1P13807 737 aa22.1■■□□□ 1.13
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ALYREF-204ENST00000512673 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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ALYREF-204ENST00000512673 RTL1A6NKG5 1358 aa22.1■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.09■■□□□ 1.13
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ALYREF-204ENST00000512673 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-204ENST00000512673 ATG3Q9NT62 314 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 RFC4P35249 363 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 GLTPD2A6NH11 291 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 DDR1Q08345 913 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-204ENST00000512673 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.02■■□□□ 1.12
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ALYREF-204ENST00000512673 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.01■■□□□ 1.11
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ALYREF-204ENST00000512673 INSRP06213 1382 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 KDRP35968 1356 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 FKBP8Q14318 412 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 ADRA2BP18089 450 aa21.98■■□□□ 1.11
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ALYREF-204ENST00000512673 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 POTEIP0CG38 1075 aa21.96■■□□□ 1.11
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ALYREF-204ENST00000512673 NEUROD1Q13562 356 aa21.96■■□□□ 1.11
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ALYREF-204ENST00000512673 FLT4P35916 1363 aa21.96■■□□□ 1.11
ALYREF-204ENST00000512673 FYB1O15117 783 aa21.95■■□□□ 1.1
ALYREF-204ENST00000512673 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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ALYREF-204ENST00000512673 CNTNAP1P78357 1384 aa21.94■■□□□ 1.1
ALYREF-204ENST00000512673 PHKG2P15735 406 aa21.93■■□□□ 1.1
ALYREF-204ENST00000512673 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.92■■□□□ 1.1
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ALYREF-204ENST00000512673 CHADLQ6NUI6 762 aa21.91■■□□□ 1.1
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ALYREF-204ENST00000512673 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ALYREF-204ENST00000512673 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.9■■□□□ 1.1
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ALYREF-204ENST00000512673 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.86■■□□□ 1.09
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ALYREF-204ENST00000512673 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.86■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 EYA1Q99502 592 aa21.86■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 TM4SF1P30408 202 aa21.85■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 TTLL6Q8N841 843 aa21.83■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
ALYREF-204ENST00000512673 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.83■■□□□ 1.08
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